Impostazioni

La schermata di configurazione di Oligo viene visualizzata dopo aver selezionato l’applicazione Oligo DNA o Oligo RNA dalla scheda Nucleic Acids (Acidi nucleici) nella schermata iniziale. Per mostrare le impostazioni di Oligo dalla schermata di misurazione di Oligo, selezionare Oligo Setup (Configurazione Oligo) .

Impostazione | Opzioni disponibili | Descrizione
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Denominazione automatica | Attivata o disattivata | Se attivata, a ciascun campione viene assegnato un nome di base predefinito (“campione”), seguito dal numero del campione nella sequenza.Ad esempio, il primo campione viene denominato “Campione 1” seguito da “Campione 2”, ecc.; è possibile modificare il nome di base predefinito e sovrascrivervi qualsiasi nome di campione.
Sequenza di basi Oligo | per DNA: utilizzare i tasti G, A, T e C per specificare la sequenza di basi del DNA per RNA: utilizzare i tasti G, A, U e C per specificare la sequenza di basi dell’RNA | Specificare la sequenza di basi di DNA o RNA. Toccare o fare clic sui tasti corrispondenti: Dal software PC Control è anche possibile inserire la sequenza di basi utilizzando la tastiera o copiando e incollando una sequenza da un’altra applicazione.
|  | Ogni volta che viene aggiunta una base alla sequenza, il software calcola quanto segue: • Fattore. Costante utilizzata per calcolare la concentrazione di oligonucleotidi nell’equazione della legge di Beer modificata. In base al coefficiente di estinzione e alla lunghezza del percorso: f = 1/(e260 * b) dove: f= fattore e = coefficiente di estinzione molare a 260 nm in ng-cm/µL b = lunghezza del percorso del campione in cm (0,1 cm per gli acidi nucleici misurati con lo strumento NanoDrop Ultra)
|  | • Peso molecolare dell’oligo calcolato dalla sequenza di basi definita dall’utente. • Numero di basi inserito. • Coefficiente di. est. molare (260 nm). Coefficiente di estinzione molare dell’oligo (in ng-cm/µL) a 260 nm calcolato dalla sequenza di basi inserita. • %GC. Percentuale di residui di guanina e citosina nel numero totale di basi inserite.
Correzione della linea di base | Attivata o disattivata Inserire la lunghezza d’onda di correzione della linea di base in nm o utilizzare il valore predefinito (340 nm) | Corregge eventuali scostamenti causati da particelle di dispersione della luce sottraendo l’assorbanza misurata alla lunghezza d’onda di correzione della linea di base specificata dai valori di assorbanza a tutte le lunghezze d’onda nello spettro del campione. Di conseguenza, l’assorbanza dello spettro del campione è pari a zero alla lunghezza d’onda di correzione della linea di base specificata. Suggerimento: se il campione presenta una modifica che assorbe la luce a 340 nm, selezionare una lunghezza d’onda di correzione diversa o disattivare la correzione della linea di base.