設定

ホーム画面の [核酸]タブから マイクロアレイアプリケーションを選択すると、[Microarray Setup（マイクロアレイ設定）]画面が表示されます。マイクロアレイ測定画面からマイクロアレイ設定を表示するには、[Microarray Setup（マイクロアレイ設定）] をタップします 。

設定 | 利用可能なオプション | 説明
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自動ネーミング | オンまたはオフ | 有効化すると、各サンプルにはデフォルトのベース名「sample」が付与され、その後にシーケンス内のサンプル番号が続きます。たとえば、最初のサンプルは「Sample 1」、続いて「Sample 2」などと名付けられます。デフォルトのベース名を編集したり、任意のサンプル名を上書きしたりすることができます。
サンプルタイプと係数 | dsDNA (50ng-cm/μLのデフォルト係数) | dsDNA の広く受け入れられている値
| ssDNA (33ng-cm/μL のデフォルト係数) | ssDNA の広く受け入れられている値
| RNA (40ng-cm/μL のデフォルト 係数) | RNA の広く受け入れられている値
| デフォルト係数により算出されたオリゴDNA（ng-cm/μL単位） | ユーザー定義の DNA 塩基配列から算出された係数。選択すると、利用可能なDNA塩基単位（つまり、G、A、T、C ）がキーとして表示されます。適切なキーをタップして配列を定義します。係数は、各塩基単位の広く受け入れられている値に基づいて自動的に算出されます。
| デフォルト係数により算出されたオリゴRNA (ng-cm/μL 単位) | ユーザー定義のRNA塩基配列から算出された係数。選択すると、利用可能なRNA塩基単位 (つまり、G、A、U、C) がキーとして表示されます。適切なキーをタップして配列を定義します。係数は、各塩基単位の広く受け入れられている値に基づいて自動的に算出されます。
| カスタム（ng-cm/μL単位のユーザー設定の吸光係数） | 15ng-cm/μL ～ 150ng-cm/μL の間で吸光係数を入力できます。
色素1/色素2 タイプ a | Cy3, 5, 3.5, or 5.5, Alexa Fluor 488, 546, 555, 594, 647, or 660 | サンプル物質にラベル付けするために使用される事前定義された色素、または[Dye/Chromophore Editor（色素/クロモフォア編集）]を使用して追加された色素を選択します。
色素1/色素2 ユニット | ピコモル/マイクロリットル (pmol/uL)、ミクロモル (uM)、またはミリモル (mM) | 色素濃度レポートのためにユニットを選択します。
分析補正 b | オンまたはオフ ベースライン補正波長（nm単位）を入力するか、既定値（340 nm）を使用してください。 | 指定された分析補正波長を、分析波長で吸光度値から差し引くことにより、光散乱粒子が原因のオフセットのサンプル吸光度測定を補正します。補正された値は、サンプル濃度の算出に使用されます。 ヒント：サンプルに340 nmで光を吸収する修飾がある場合、別の補正波長を選択するか、[Baseline Correction（ベースライン補正）]をオフにします。

aカスタム色素を追加するか、利用可能な色素のリストを編集するには、[Dye/Chromophore Editor（色素/クロモフォア編集）]を使用します。 b分析補正は、核酸濃度のみの算出に影響します。

色素/クロモフォア編集

[Dye/Chromophore Editor（色素/クロモフォア編集）]を使用して、[Microarray Setup（マイクロアレイ設定）]または [Proteins & Labels Setup（タンパク質とラベル設定）]の利用可能な色素のリストに、カスタム色素を追加します。また、そのリストから利用可能な色素を指定できます。

Dye/Chromophore Editor（色素/クロモフォア編集）にアクセスする方法：

• ホーム画面から [Settings（設定）] を選択し、次に [Dye Editor（色素編集）]を選択します。

これらの操作は [Dye/Chromophore Editor:（色素/クロモフォア編集）]から行うことができます。

カスタム色素の追加

1. [Dye Editor（色素編集）]内で を選択して、[Add Dye（色素を追加）]ボックスを表示します。

2. 新しい色素の一意の名前を入力します（ローカル制御ソフトウェアを使用する場合は、フィールドをタップしてキーボードを表示し、[Done（完了）]キーでキーボードを閉じます）。

3. 色素濃度を表示するために使用されるデフォルトの単位を選択します。

4. 色素の吸光係数(またはモル吸光定数) を L/mole-cm 単位で入力します (色素の適切な補正ファクターは色素メーカーにお問い合わせください)。

5. 色素の吸光度を測定するために使用される、波長を nm 単位で指定します (350nm ～ 840nm の範囲)。

6. 260nm および 280nm での色素の補正値を指定します。

7. [Save（保存）]を選択して、[Add Dye（色素を追加）]ボックスを閉じます。

新しいカスタム色素が、[Microarray Setup（マイクロアレイ設定）]および [Proteins and Labels Setup.（タンパク質とラベル設定）]の[Dye 1（色素1）[および[Dye 2（色素2）]リストに表示されます。

注意 色素補正値の測定方法（色素メーカーから入手できない場合）： –機器を使用して純粋な色素を測定し、色素の 260nm、280nm、および分析波長での吸光度を書き留めます (以下を参照してください)。 –A260/Adye wavelengthの比率を算出し、260nm 補正用にその値を入力します。 –A280/Adye wavelengthの比率を算出し、280nm 補正用にその値を入力します。

測定前にカスタム色素が選択されている場合、色素の吸光度および濃度の値が報告され、測定されたサンプル吸光度値、およびその結果生じるサンプル濃度と純度比に補正が適用されます。

カスタム色素の編集

ヒント ソフトウェアにプリプログラムの色素は編集できません。

1. [Dye Editor（色素編集）]で、編集が必要な目的のカスタム色素の行のを選択します。

2. を選択します 。

3. 入力内容または設定を編集します。

4. [Save（保存）]を選択します。

カスタム色素の削除

ヒント ソフトウェアにプリプログラムの色素は削除できません。

1. [Dye Editor（色素編集）]で、各カスタム色素の左側にあるチェックボックスを使用して、削除する1つ以上のカスタム色素を選択します。

2. を選択します。

3. [Yes（はい）]を選択し、削除を確認します。

注意事項 カスタム色素を完全に削除すると、色素とその関連情報のすべてがソフトウェアから削除されます。