設定

タンパク質A280 Proアプリケーションは、精製済みタンパク質分析のためのさまざまなサンプルタイプオプションを提供します。

各サンプルタイプは、独自の吸光係数をタンパク質の算出に適用します。サンプルの吸光係数が分かっている場合は、e + MW (モル) またはe1%（質量）オプションを選択し、値を入力します。係数が分からない場合は、吸光係数を算出するか、またはサンプル溶液に最適なオプションを選択します。タンパク質濃度の概算のみが必要で、サンプルの吸光係数が不明な場合は、1 Abs = 1 mg/mLサンプルタイプオプションを選択します。

ヒント 理想的には、吸光係数は同じ緩衝液を使用して、既知の濃度で研究対象タンパク質の溶液を使用して実験的に決定される必要があります。

タンパク質A280設定画面は、ホーム画面の [Acclaro Pro]タブからアプリケーションを選択した後に表示されます。タンパク質A280 Pro設定を表示するには、タンパク質A280 Pro測定画面から を選択します。

設定 | 利用可能なオプ ション | 質量吸光 係数（L/gm-cm） | 説明
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自動ネーミング | オンまたはオフ | 該当なし | 有効化すると、各サンプルにはデフォルトのベース名「sample」が付与され、その後にシーケンス内のサンプル番号が続きます。たとえば、最初のサンプルは「Sample 1」、続いて「Sample 2」などと名付けられます。デフォルトのベース名を編集したり、任意のサンプル名を上書きしたりすることができます。
ベースライン補正 | オンまたはオフ ベースライン補正波長（nm単位）を入力するか、既定値（340 nm）を使用してください。 | 該当なし | 指定されたベースライン補正波長を、サンプルスペクトルのすべての波長で吸光度値から差し引くことにより、光散乱粒子が原因のオフセットを補正します。その結果、サンプルスペクトルは指定されたベースライン補正波長で吸光度がゼロとなります。 ヒント：サンプルに340 nmで光を吸収する修飾がある場合、別の補正波長を選択するか、[Baseline Correction（ベースライン補正）]をオフにします。
サンプルタイプ a | 1 Abs = 1 mg/mL | 一般リファレンス | 吸光係数が分からず、タンパク質濃度の概算が、他に妨害成分がない溶液の許容範囲内である場合に推奨されます。0.1%（1 mg/mL）タンパク質溶液は、280 nm（光路長が10 mmの場合）で1.0Aを生成する、つまりe1% = 10と仮定します。
| BSA | 6.7 | 1%（つまり、10 mg/mL）のBSA溶液に対して、280 nmで 6.7 L/gm-cmの質量吸光係数 (e) を使用して、ウシ血清アルブミン（BSA）タンパク質濃度を計算します。MWが 66,400 Da（ダルトン）であると仮定して、BSAの280 nmでのモル吸光係数は、約43,824M-1cm-1になります。
| IgG | 13.7 | 大部分の哺乳類抗体（つまり、免疫グロブリンGまたはIgG）に適しています。1%（つまり、10 mg/mL）のIgG溶液に対して、280 nmで13.7 L/gm-cmの質量吸光係数 (e) を使用してタンパク質濃度を算出します。MWが150,000 Daであると仮定して、IgGの280nmでのモル吸光係数は、 約 210,000M-1cm-1 になります。
| リゾチーム | 26.4 | 1%（つまり、10 mg/mL）のリゾチーム溶液に対して、280nmで26.4 L/gm-cmの質量吸光係数 (e ) を使用してリゾチームタンパク質濃度を算出します。卵白リゾチームのモル吸光係数は36,000M-1cm-1 ～ 39,000M-1cm-1の範囲であると仮定します。
| その他のタンパ ク質 （e + MW） | ユーザーが入力したモル吸光係数および分子量 | タンパク質に以下のような既知のモル吸光係数（e) と分子量（MW）があると仮定します。 (emolar)*10=(epercent)*(MWprotein) MWをキロダルトン（kDa）単位で入力し、モル吸光係数（e) ）（M-1cm-1単位）を1000で割ります（つまり、e/1000）。たとえば、210,000 M-1cm-1のモル吸光係数を持つタンパク質の場合、210を入力します。
| その他のタンパ ク質 (e1%) | ユーザーが入力した質量吸光係数 | タンパク質に既知の質量吸光係数（e）があると仮定します。10 mg/mL（e1%）タンパク質溶液の質量吸光係数（L/gm-cm 単位）を入力します。

aカスタムタンパク質を追加したり編集したりするには、タンパク質編集を使用します。