Ustawienia

Ekran Ustawień białka A280 pojawia się po wybraniu funkcji z zakładki Proteins (Białka) na ekranie głównym. Aby wyświetlić ustawienia białka A280, z odpowiedniego ekranu pomiarowego należy wybrać ikonę Setup (Ustawienia)

Funkcja Białko A280 umożliwia zastosowanie różnych metod do analizy białek.

Każdy typ próbki stosuje unikalny współczynnik ekstynkcji do obliczeń białek. Jeśli współczynnik ekstynkcji próbki jest znany, należy wybrać opcję e + MW (molowy) lub e1% (masowy) i wprowadzić wartość. W przeciwnym razie należy obliczyć współczynnik ekstynkcji lub wybrać opcję, która najlepiej pasuje do danego roztworu próbki. Jeśli potrzebne jest tylko przybliżone oszacowanie stężenia białka, a współczynnik ekstynkcji próbki jest nieznany, należy wybrać opcję typu próbki 1 Abs=1 mg/ml.

Wskazówka Najlepiej, jeśli współczynnik ekstynkcji zostanie określony empirycznie przy użyciu roztworu badanego białka o znanym stężeniu przy użyciu tego samego buforu.

Ustawienia | Dostępne opcje | Masowy współczynnik ekstynkcji (l/gm-cm) | Opis
--- | --- | --- | ---
Auto Naming (Automa- tyczne nazywanie) | On (Włączone) albo Off (Wyłączone) | Nie dotyczy | Gdy opcja ta jest włączona, każdej próbce nadawana jest domyślna nazwa podstawowa „sample”, po której następuje numer próbki w sekwencji. Na przykład pierwsza próbka będzie miała nazwę „Sample 1”, a następnie „Sample 2” itd. Można edytować domyślną nazwę podstawową i nadpisać ją dowolną nazwą próbki.
Baseline correction (Korekta sygnału bazowego) | On (Włączone) albo Off (Wyłączone) Należy wprowadzić wartość korekty długości fali sygnału bazowego w nm lub użyć wartości domyślnej (340 nm) | Nie dotyczy | Oprogramowanie koryguje wszelkie przesunięcia spowodowane rozpraszaniem światła przez cząstki stałe poprzez odjęcie absorbancji zmierzonej po korekcie długości fali sygnału bazowego od wartości absorbancji dla wszystkich długości fal w widmie próbki. W rezultacie absorbancja widma próbki wynosi zero przy określonej długości fali sygnału bazowego. Wskazówka: Jeśli próbka ma modyfikację, która pochłania światło o długości fali 340 nm, należy wybrać inną korektę długości fali lub wyłączyć korektę sygnału bazowego.
Sample type (Typ próbki)a | 1 Abs = 1 mg/ml | General reference (Wzorzec ogólny) | Zalecane, gdy współczynnik ekstynkcji jest nieznany, a przybliżone oszacowanie stężenia białka jest akceptowalnym wynikiem dla roztworu bez innych substancji zanieczyszczających go. Przy założeniu, że 0,1-procentowy (1 mg/ml) roztwór białka wytwarza 1,0 A przy 280 nm (gdzie długość ścieżki wynosi 10 mm), tj. e1% = 10.
| BSA (Albumina surowicy bydlęcej) | 6,7 | Oblicza stężenie białka BSA (albumina surowicy bydlęcej) na podstawie masowego współczynnika ekstynkcji (e) równego 6,7 l/gm-cm przy 280 nm dla 1-procentowego (tj., 10 mg/ml) roztworu BSA. Zakładając, że MW wynosi 66 400 daltonów (Da), molowy współczynnik ekstynkcji przy 280 nm dla BSA wynosi około 43 824 M-1cm-1.
| IgG | 13,7 | Odpowiedni dla większości przeciwciał ssaków (tj. immunoglobulina G lub IgG). Oblicza stężenie białka na podstawie masowego współczynnika ekstynkcji (e) równego 13,7 l/gm-cm przy 280 nm dla 1-procentowego (tj., 10 mg/ml) roztworu immunoglobuliny. Zakładając, że MW wynosi 150 000 daltonów (Da), molowy współczynnik ekstynkcji przy 280 nm dla IgG wynosi około 210 000 M-1cm-1.
| Lysozyme (Lizozym) | 26,4 | Oblicza stężenie lizozymu na podstawie masowego współczynnika ekstynkcji (e) równego 26,4 l/gm-cm przy 280 nm dla 1-procentowego (tj., 10 mg/ml) roztworu lizozymu. Przy założeniu, że współczynnik ekstynkcji molowej dla lizozymu białka jaja kurzego wynosi od 36 000 M-1cm-1 i 39 000 M-1cm-1.
| Other protein (Inne białko) (e + MW) | Wprowadzony przez użytkownika molowy współczynnik ekstynkcji i masa cząsteczkowa | Przy założeniu, że białko ma znany molowy współczynnik ekstynkcji (e) i masę cząsteczkową (MW), gdzie: (emolowy)*10=(eprocent)*(MWbiałko) Należy podać MW w kilodaltonach (kDa) i molowy współczynnik ekstynkcji (e) w M-1cm-1 podzielone przez 1000 (tj. e/1000). Na przykład, dla białka o molowym współczynniku ekstynkcji 210 000 M-1cm-1, należy podać 210.
| Other protein (Inne białko) (e1%) | Wprowadzony przez użytkownika masowy współczynnik ekstynkcji | Zakłada, że białko ma znany masowy współczynnik ekstynkcji (e). Należy podać masowy współczynnik ekstynkcji w l/gm-cm dla roztworu białka 10 mg/ml (e1%).

aAby dodać lub edytować białko niestandardowe, należy użyć opcji Protein Editor (Edytor białek).