Ustawienia

Ekran konfiguracji Oligo DNA Pro lub Oligo RNA Pro pojawia się po wybraniu odpowiedniej funkcji w zakładce Acclaro Pro na ekranie głównym. Aby wyświetlić Ustawienia Oligo Pro (Oligo Pro Setup), należy wybrać tę opcję na ekranie pomiarowym Oligo Pro

Ustawienia | Dostępne opcje | Opis
--- | --- | ---
Auto Naming (Automatyczne nazywanie) | On (Włączone) lub Off (Wyłączone) | Gdy opcja ta jest włączona, każdej próbce nadawana jest domyślna nazwa podstawowa „sample”, po której następuje numer próbki w sekwencji. Na przykład pierwsza próbka będzie miała nazwę „Sample 1”, a następnie „Sample 2” itd. Można edytować domyślną nazwę podstawową i nadpisać ją dowolną nazwą próbki.
Sekwencja zasad oligonukleotydu | W przypadku DNA: należy użyć symboli G, A, T i C do określenia sekwencji zasad DNA W przypadku RNA: należy użyć symboli G, A, U i C do określenia sekwencji zasad RNA | Należy określić sekwencję zasad DNA lub RNA. Należy wybrać/wcisnąć odpowiednie przyciski: Z poziomu oprogramowania sterującego PC można również wprowadzić sekwencję bazową za pomocą klawiatury lub kopiując i wklejając sekwencję z innej aplikacji.
|  | Za każdym razem, gdy zasada jest dodawana do sekwencji, oprogramowanie oblicza następujące wartości: • Factor (Parametr). Stała używana do obliczania stężenia oligonukleotydów w zmodyfikowanym równaniu prawa Beera. Na podstawie współczynnika ekstynkcji i długości ścieżki: f = 1/(e260 * b) gdzie: f= parametr e = molowy współczynnik ekstynkcji przy długości fali 260 nm w ng-cm/µl b = długość ścieżki próbki w cm (0,1 cm dla kwasów nukleinowych mierzone za pomocą instrumentu NanoDrop Ultra)
|  | • Molecular Weight (Masa cząsteczkowa) oligo obliczona na podstawie sekwencji zasad zdefiniowanej przez użytkownika. • Number of Bases (Liczba zasad) wprowadzona. • Molar Ext. Coefficient (Współczynnik ekst. molowej [260 nm]). Współczynnik ekstynkcji molowej oligonukleotydu (w ng-cm/µl) przy długości fali 260 nm obliczony na podstawie wprowadzonej sekwencji zasad. • %GC. Odsetek reszt guaniny i cytozyny w całkowitej liczbie wprowadzonych zasad.
Baseline correction (Korekta sygnału bazowego) | On (Włączone) lub Off (Wyłączone) Należy wprowadzić wartość korekty długości fali sygnału bazowego w nm lub użyć wartości domyślnej (340 nm) | Oprogramowanie koryguje wszelkie przesunięcia spowodowane rozpraszaniem światła przez cząstki stałe poprzez odjęcie absorbancji zmierzonej po korekcie długości fali sygnału bazowego od wartości absorbancji dla wszystkich długości fal w widmie próbki. W rezultacie absorbancja widma próbki wynosi zero przy określonej długości fali sygnału bazowego. Wskazówka: Jeśli próbka ma modyfikację, która pochłania światło o długości fali 340 nm, należy wybrać inną korektę długości fali lub wyłączyć korektę sygnału bazowego.

Powiązane tematy

• Instrument Settings (Ustawienia instrumentu)