Ajustes

La pantalla Microarray Setup (Configuración de micromatrices) aparece después de seleccionar la aplicación Microarray en la pestaña Nucleic Acids (Ácidos nucleicos) en la pantalla de inicio. Para mostrar la configuración de micromatrices en la pantalla de medición de micromatrices, seleccione Microarray Setup (Configuración de micromatrices) .

Configuración | Opciones disponibles | Descripción
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Denominación automática | On (activado) u Off (desactivado) | Cuando está habilitado, a cada muestra se le asigna un nombre inicial predeterminado “sample” (muestra), seguido del número de muestra en la secuencia. Por ejemplo, la primera muestra se llamaría “Sample 1” (Muestra 1), seguida de “Sample 2” (Muestra 2), etc. Puede modificar el nombre inicial predeterminado y sobrescribir cualquier nombre de muestra.
Tipo de muestra y factor | ADNbc (con factor no editable de 50 ng-cm/µl) | Valor ampliamente aceptado para el ADN bicatenario
| ADNbc (con factor no editable de 33 ng-cm/µl) | Valor ampliamente aceptado para el ADN monocatenario
| ARN (con factor no editable de 40 ng-cm/µl) | Valor ampliamente aceptado para el ARN
| ADN de oligonucleótido con factor calculado no editable en ng-cm/µl | Factor calculado a partir de la secuencia de bases de ADN definida por el usuario. Cuando se selecciona, las unidades de base de ADN disponibles (es decir, G, A, T, C) aparecen como claves. Defina la secuencia tocando las teclas correspondientes. El factor se calcula automáticamente en función del valor ampliamente aceptado para cada unidad base.
| ARN de oligonucléotido con factor calculado no editable en ng-cm/µl | Factor calculado a partir de la secuencia de bases de ARN definida por el usuario. Cuando se selecciona, las unidades de base de ARN disponibles (es decir, G, A, T, C) aparecen como claves. Defina la secuencia tocando las teclas correspondientes. El factor se calcula automáticamente en función del valor ampliamente aceptado para cada unidad base.
| Personalizado (con factor especificado por el usuario en ng-cm/µl) | Ingrese un factor entre 15 ng-cm/µl y 150 ng-cm/µl
Tipo de tinte 1/tinte 2 a | Cy3, 5, 3,5 o 5,5, Alexa Fluor 488, 546, 555, 594, 647 o 660 | Seleccione los tintes predefinidos utilizados para etiquetar el material de muestra, o uno que se haya agregado utilizando el Dye Editor (Editor de tintes).
Unidad de tinte 1/tinte 2 | picomoles/microlitro (pmol/ul), micromoles (uM) o milimoles (mM) | Seleccione la unidad para informar las concentraciones de tinte.
Corrección del análisis b | On (activado) u Off (desactivado) Ingrese la longitud de onda de corrección inicial en nm o use el valor predeterminado (340 nm). | Corrige cualquier desviación en la medición de absorbancia causada por partículas de dispersión de luz, al restar el valor de absorbancia en la longitud de onda de corrección de análisis especificada al valor de absorbancia en la longitud de onda del análisis. El valor corregido se utiliza para calcular la concentración de la muestra. Sugerencia: si la muestra tiene una modificación que absorbe luz a 340 nm, seleccione una longitud de onda de corrección diferente o desactive la corrección del análisis.

aPara agregar un tinte personalizado o modificar la lista de tintes disponibles, use el editor de tintes/cromóforos. bLa corrección del análisis afecta únicamente el cálculo de la concentración de ácido nucleico.

Editor de tintes/cromóforos

Utilice el Editor de tintes/cromóforos para agregar un tinte personalizado a la lista de tintes disponibles en Microarray Setup (Configuración de micromatrices) o Proteins & Labels Setup (Configuración de proteínas y etiquetas). También puede especificar qué tintes están disponibles en esa lista.

Para acceder al Editor de tintes/cromóforos:

• En la página de inicio, seleccione Settings (Ajustes) y luego seleccione Dye Editor (Editor de tintes)

Estas operaciones están disponibles en el Editor de tintes/cromóforos:

Agregar tinte personalizado

1. En el Editor de tintes, seleccione para mostrar el cuadro Add Dye (Agregar tinte).

2. Ingrese un nombre único para el nuevo tinte (toque el campo para acceder al teclado cuando use el software de control local, seleccione Done [Listo] para cerrar el teclado).

3. Seleccione la unidad predeterminada que se utilizará para mostrar la concentración del tinte.

4. Ingrese el coeficiente de extinción del tinte (o la constante de absortividad molar) en l/mol-cm (generalmente proporcionado por el fabricante del tinte).

5. Especifique la longitud de onda en nm (entre 350 nm y 840 nm) que se utilizará para medir la absorbancia del tinte.

6. Especifique los valores de corrección del tinte a 260 nm y 280 nm

7. Seleccione Save (Guardar) para cerrar el recuadro Add Dye (Agregar tinte).

El nuevo tinte personalizado aparece en las listas Dye 1 (Tinte 1) y Dye 2 (Tinte 2) en Microarray Setup (Configuración de micromatrices) y Proteins and Labels Setup (Configuración de proteínas y etiquetas).

Nota Para determinar los valores de corrección del tinte (si no están disponibles a través del fabricante del tinte): –Use el instrumento para medir el tinte puro y observe la absorbancia a 260 nm, 280 nm y en la longitud de onda de análisis del tinte (consulte la sección anterior). –Calcule la relación de A260/Alongitud de onda del tinte e ingrese ese valor para la corrección de 260 nm. –Calcule la relación de A280/Alongitud de onda del tinte e ingrese ese valor para la corrección de 280 nm.

Cuando se selecciona un tinte personalizado antes de una medición, se informan los valores de absorbancia y concentración del tinte y las correcciones se aplican a los valores de absorbancia de la muestra medidos, y a las concentraciones de la muestra resultantes y las relaciones de pureza.

Modificar tinte personalizado

Sugerencia Los tintes predefinidos en el software no se pueden editar.

1. En Dye Editor (Editor de tintes), seleccione en la fila del tinte personalizado deseado que debe modificarse.

2. Seleccione .

3. Modifique cualquier entrada o ajuste.

4. Seleccione Save (Guardar).

Eliminar un tinte personalizado

Sugerencia Los tintes predefinidos en el software no se pueden eliminar.

1. En Dye Editor (Editor de tintes), seleccione uno o más tintes personalizados para eliminar mediante las casillas de verificación a la izquierda de cada tinte personalizado deseado.

2. Seleccione .

3. Seleccione Yes (Sí) para confirmar la eliminación.

AVISO Al eliminar un tinte personalizado, se elimina permanentemente el tinte y toda la información asociada del software.